（光绪二十四年 戊戌）
2月1日（一月十一日） 何嗣焜总理呈文盛宣怀，报告外院开办情况，并呈送高等小学堂（即外院）章程。外院作为中学堂的预科，分三学级，3年毕业考试合格者，升入中院。2月4日盛宣怀批复：章程各条均极周妥，尽快招收中院第四班学生30名，赶紧开设中院。
高等小学堂章程共6章24节。其“立学总义”指出：“矫近代教育偏重文字之弊，设普通完备学科，使学者得受普通之知识为主义。”其中规定第三年课程有：读经、修身、国文、算术、商业簿记、历史、地理、理科、习字、图画、体操、乐歌、英文、手工等，合计每周36小时。
4月22日（闰三月初三） 中院开学。从外院的大班、次大班中挑选中、西学合格学生20人，作为中院第四班，暂令师范院学生董瑞椿、杨志洵等担任华课教习，并由师范院教习暂时分任西文、西课教习。
6月12日（四月二十四日） 盛宣怀向清政府呈奏“筹集商捐开办南洋公学情形折”，全面报告了筹集商捐开办南洋公学的经过，包括委派总理，设立师范院、外院、中院和上院，并说明南洋公学培养学生，居内政、外交、理财3事，3年期满后应择优予以褒奖。还报告了公学经费捐集和开支的情况。同时附“南洋公学章程”供御览。7月6日（五月十八日）光绪皇帝朱批：“该衙门知道，单并发，钦此”，并在清单“南洋公学章程”上朱批了一个“览”字。
该“章程”共8章20节，对于设学宗旨，分设师范、上、中、外4个院，课程，考试，发凭据，藏书、译书，教员和管理员名额等都作了明确规定。指出公学学生要通达中国经史大义，通算、化、格致，还要分别略通工艺、机器制造、矿冶诸学，以培养政治家为最终目的。1897年8月，《萃报》刊有“南洋公学纲领和简明章程”，内容与该章程基本相同。
6月12日（四月二十四日） 盛宣怀向清政府附奏“南洋公学附设译书院片”，该片指出，中国近30年所译西书数量少，且大都为算、化、工艺诸学，旧的译述多为陈编，政治之书最少，不适应成名成材需要。拟在“南洋公学内设立译书院一所，广购日本及西国新出之书，延订东、西博通之士择要翻译，令师范院诸生之学识优良者笔述之。”“译书院经费即在公学捐款通融拨用”。7月6日（五月十八日），光绪皇帝朱批：“著照所拟办理，钦此。”南洋公学设立译书院业经清政府最高当局批准，并正式设立。南洋公学在译书院正式成立前，已于1897年以铅字印刷了《蒙学课本》等教科书。
在此前后，盛宣怀先后于6月22日、11月5日亲自聘任日本陆军大尉细田谦藏、稻村新六两人为南洋公学译书院译员和翻译兵书顾问。
6月12日（四月二十四日） 盛宣怀附奏“新设各学堂请免岁科两试片”。该片指出：“拟请嗣后新设各学堂、书院内，凡系廪、增、附生一体免予岁、科两试，使得专精新学。”7月6日（五月十八日）光绪皇帝朱批：“著照所请，礼部知道，钦此。”批准了盛宣怀所请。此后，包括南洋公学在内的全国各新设学堂均按此办理。
6月（五月） 选定上海之西、明代科学家徐光启故里徐家汇为公学校址。购买土地6﹒5公顷，中院校舍开始建造。
6月（五月） 张焕纶因病辞去华课总教习职务。
7月14日（五月二十六日） 何嗣焜总理向盛宣怀报告，现有师范生27人的分格给据情况：给5层格据者3人，给4层格据者1人，给3层格据者9人，给2层格据者6人，给1层格据者8人。呈请给师范生除膏火外，另行分别给予津贴。
7月（六月） 聘李维格为提调（教务负责人），接替张焕纶职务。李维格为颇负盛名的翻译家。
9月2日（七月十七日） 何嗣焜总理呈文盛宣怀，遵照京师大学堂奏定章程，宜将中、上两院学生的津贴裁掉，改发奖赏。9月7日（七月二十二日），盛宣怀复文：“改将津贴额银按六折于每月查课时分别给奖。”
11月30日（十月十六日） 何嗣焜总理呈文盛宣怀，现将经过屡次更改南洋公学现行课程学规辑为一册，呈请察核。嗣后如有改易，当照东西各国学堂之例，于每年年终后续行汇辑，印成南洋公学章程。
12月27日（十一月十五日） 经奏准，清政府总理各国事务衙门决定派出公费赴日留学生20名。其中分派给南洋公学6名。十一月十五日，盛宣怀致函公学总理何嗣焜，请挑选师范生2名，中院生4名赴日本留学。
本年 中院开设后，规定将兵式体操列为正课，由英文教员吴键、胡诒谷等相继教练兵操。
本年 师范院开始无固定课程表，本年后开始按学科分班授课，即按程度不同，分别教授中课、西课、西文等。
本年 收招商局规元9万两，收电报局规元4万两。本年购徐家汇地支银8785两。
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