2月（一月） 修订“邮传部上海高等实业学堂章程”，对教学、生活、品行、课程设置、工作职责等都作了详细规定，并增加了“各省官费生章(程)”和“校外通学生章(程)”。
2月（一月） 聘请民间拳术教师刘震南为教练，教授学生技击运动。
4月（三月） 清政府学部调去年全国各省、部高等学堂各科毕业生140人，赴京进行复试，并详细校阅毕业生在校期间的各门试卷。结果取列为最优等的共6人，优等的共49人。上海高等实业学堂第二届铁路专科毕业生除已出国留学等外，有5人参加复试。李保龄、康时清、陆世勋3人被列为最优等，周熙、梁树钊2人被列为优等。为此，学部、邮传部在奏折中传旨褒奖最优等、优等毕业生的同时，并嘉奖上海高等实业学堂铁路专科和学校监督、教员及管理人员。
4月（三月） 邮传部决定将航海专科扩充改办成商船学校，校址设于上海吴淞，9月（八月）正式成立，派夏孙鹏任该校主任。
购学堂东南房屋及民地约1.33公顷，以添建宿舍。
3～4月（二三月） 江淮水灾，全校减膳助赈。
5月（四月） 唐文治总结办学经验，撰写“咨邮传部转咨学部文”。陈述教育为立国之命根。要求教育“要以尚实为宗旨，使之趋重于实学”。引导学生重实学，戒虚荣。并对减少过多的考试、改进考试制度和普及教育等方面提出了不少建议。
5月（四月） 派铁路专科第二届毕业学生李保龄、康时清、陆世勋、周熙、梁树钊5人赴英国留学。
5月（四月） 由体操教员魏旭东带学生轮流赴苏州城外商团靶场进行实弹射击。
7月（六月） 电机专科首届毕业学生孙世缵等10人。电机专科科长谢尔屯（美籍）介绍电机专科毕业生孙世缵、孙宝鉴、邓福培、华荫薇、钟锷、郎国桢、朱福颐、孙世芬8人赴美国电厂实习。由工厂发给月薪，以资旅费。学校学生赴外国工厂实习自此开始。
中学第十二届毕业学生郑维藩等77人，小学第八届毕业学生沈学洪等40人。
暑假后招生，报考者已达1 000余人，而各科所取专科学生仍不过10名左右。
9月（八月） 举办国文大会，因江淮水灾，将奖金作为赈灾捐款。
10月（九月） 10日爆发“武昌起义”，学校师生积极响应。当晚，在中院的钟楼顶插上白旗，以表示拥护革命军，第二天学生们冲出校门，用步枪击中并打翻李鸿章的铜像，组织义勇军，卫护学校，募集军饷，支援上海革命军。
校长唐文治约请上海著名人士致电摄政王，奉劝清室自动退位，改行共和政体。
教务长辜鸿铭辞职。
11月3日 师范院肆业生钮永建（字铁生）领导学生军攻打制造局。当日晚，上海人民起义获得了胜利。
11月 校名更改为“南洋大学堂”。监督改称校长，由唐文治任校长。
12月 上海各公立学校因经费无着，纷纷停课。本校提用招商、电报两局历年积余存款，经费十分拮据。唐文治带头每月减薪50%，全校教职员年薪按10个月计算，勉强维持正常上课。
12月 首次使用公历年号放寒假。
12月 参加意大利都灵万国博览会的学生作业和成绩展品获得最优等奖。
12月 小学主任林祖溍辞职，教员沈鸿庆继任至1927年。林、沈都是公学师范班学生，从小学开办时任教至今。
12月底 孙中山在将赴南京就任临时大总统前夕，莅临学校发表讲演，论述交通建设对振兴我国实业、巩固我国国防的重要性，要求同学们发奋学习，掌握科学技术，以期在科学上迎头赶上欧、美强国。讲话时间长达2小时。
本年 全校有铁路专科3个班，电机专科3个班，附中10个班，附小4个班，加上商船学校8个班，共有学生900余人。
至本年 自1905～1911年，即高等实业学堂时期，建成风雨操场和附属小学一所，建成了金工厂、电机厂、木工厂，在中院后添建宿舍，并建筑了校外宿舍等。
至本年 自1907～1911年底，专科共毕业3届，计28人，肄业1届共13人。其中30人派往英、美等国留学；中学毕业学生271人；小学毕业学生 173人。
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