1966年（5～12月）
5月16日 中共中央发出关于开展无产阶级文化大革命的“五·一六”通知，全国范围的“文革”开始。
5月17日 彭康召开党委会，讨论“文化大革命”问题。党委宣传部长吴镇东传达了中共陕西省委文化大革命座谈会精神。
5月22日 校党委扩大会议继续讨论文化大革命。会上首先传达了中央“五·一六”通知。
5月24日～6月1日 校党委组织党委委员和处以上干部学习中央“五·一六”通知，讨论文化大革命。
6月1日 全校收听《人民日报》发表“横扫一切牛鬼蛇神”的社论，晚上中央人民广播电台广播了北大聂元梓等人写的大字报。
晚上，彭康召开党委扩大会，在中共陕西省委的压力下，会上重新提出马列主义教研室主任凌雨轩问题，认为凌的问题，过去定政治性认识错误不对，应定为反党、反社会主义。
6月2日 在北大第一张大字报的影响下，学校贴出了数以万计的大字报，矛头指向以彭康为首的校党委。学校秩序大乱，全校停课。校党委向全校抛出凌雨轩问题，把凌雨轩同志打成反党、反社会主义的修正主义分子。
6月3日晚 中共陕西省委派出以严克伦为首的工作组进驻学校，领导西安交大的“文化大革命”。工作组后来扩大为工作团。
6月5日晚 学生李世英等人贴出“坚决赶走工作组”的大字报。校园内先后出现许多反对工作组的大字报。
6月6日 工程物理系810（41）班学生贴出大字报，列举工作组“十大罪状”，说陕西省委工作组是冒牌的，省委里有反革命黑帮。学生纷纷打电报给党中央、毛主席，要求派人来校处理问题，其中一份电报有1 683人签名。一部分学生与工作组辩论，一些学生组织赴京代表团（实际上京的仅2人）。还有许多学生上街，到工厂、农村串联。这就是在当时影响很大的交大“六六”事件。
6月8日 工作团宣布接管交大全部权力。此后，在工作团的领导和组织下，从6月初到7月在全校师生员工中，大搞“查上当，放包袱”，挖“六六”事件的幕后策划者。1 000多人被斗，许多学生被打成反革命，许多同志被打成“彭康黑帮”。
6月9日 遭受工作团组织批斗的工物系810（41）班学生李世英，留下遗书，服安眠药自杀，后经医院抢救脱险。
6月17日 中共陕西省委宣布彭康同志为反党反社会主义分子，并作出“撤销西安交通大学党委书记兼校长彭康的一切职务”的决定。同时改组西安交通大学党委。在西安交大党委改组期间，由工作团党委代行校党委的职权。林星（党委副书记）、凌雨轩同志也被定为三反分子，并撤销一切职务。
6月18日 工作团召开西安交大15 000多人大会，揭发、声讨原党委书记兼校长彭康同志的所谓反党、反社会主义、反毛泽东思想的罪行。
7月6～8日 工作团召开西安交大文化革命委员会第一次会员代表大会，选举产生了校文化大革命委员会。工作团长严克伦在7月6日的第一次会员代表大会上颠倒黑白，宣布彭康同志为叛徒。
7月9日 校学生会劳动生活部部长王永婷，因“六六”事件，被工作团多次组织批斗，跳楼自杀身亡。
8月5日 8月3日中央决定撤销工作组。中共陕西省委传达中央会议精神，工作团停止活动。
8月8日 中共中央通过“关于文化大革命的决定”，即“十六条”。
8月中旬 工作团停止活动以后，学校各种战斗队、兵团、调查组、通讯社等成百个出现。校内出现了押人游街、戴高帽子、罚跪、勒令“黑帮”劳动、搞活人展览、破“四旧”抄家等现象，致使许多干部、群众深受其害。
8月13日 学校召开万人辩论大会，批判工作团，提出从“反对工作团入手，深挖陕西省委、西北局的黑根黑线”。
8月14～16日 西安交大学生贴出“炮轰陕西省委，火烧西北局”，“造反有理”的大字报、大标语。
8月16日 中共陕西省委在西北体育场召开大会，宣布撤销工作团。同一天，西安交大、西工大等院校师生在省委门口静坐示威，抗议14~16日在省委门前围斗、殴打师生的“暴行”，静坐持续到8月18日。
8月20日 西安市举行50万人的“文化大革命”誓师大会，交大7 000～8 000师生参加游行时发生学生被围打事件。
8月下旬 工作团撤走后，“造反派”改组了学校“文化革命委员会”，由学生李世英任主任。改组后的文革委员会，称“文革总会”，并随之成立了交大红卫兵总部。
9月6～9日 西安交大学生声援西安工业学院造反派，在陕西省委门前进行了静坐绝食。随后，西安交大与其他院校统一组织了造反组织“西安地区大专院校造反统一指挥部”（简称“统指”）和“红卫兵造反司令部”。
9月 学校广播台成立炮打司令部红色尖兵队，主要调查陕西省委、西北局主要领导人的历史和现实问题。随后，西安交大文革总会又派人调查西北局第一书记刘澜涛的材料，与南开大学等校联合调查1936年北平反省院61位同志集体出狱的问题。
10月 大批师生到北京和全国各地串联，随后大规模下厂、下乡。
11月2日 “西安—韶山”长征队出发，随后有“西安—延安”、“二万五千里”长征队以及许多人数不等的大小战斗队相继出发到全国各地长征串联。
从1966年底至1967年初，学校师生先后有2 500多人徙步串联，4 000多人次下工厂、农村参加社会上的“文化大革命”。
年底 全校在校学生9 500余人，有教职工2 793人，其中教师1 158人（教授22人，副教授60人）。
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