1996年4月8日，是我校建校100周年暨迁校40周年纪念日。校庆纪念活动于4月7日至9日和6月29日至7月1日分两阶段进行，后一阶段主要是安排部分海内外校友返校团聚活动。
4月8日上午9时，“西安交通大学建校100周年暨迁校40周年纪念大会”在田径场召开。出席大会的有全国人大、国防科工委、国家计委、共青团中央和陕西省等部门的主要领导，以及学术教育界知名人士，海内外兄弟院校领导，著名企业家代表等。会上，首先播放了江泽民学长给百年校庆纪念大会的贺词录音，校党委书记潘季致辞，并转达了丁关根学长对学校师生的亲切问候和希望，以及老校友陆定一同志对交大人的深情致意与期望。随后国家教委、陕西省等领导，清华、伯克利、香港理工等大学校长，以及交大美洲校友会代表郑国宾，校友熊有伦院士等分别讲话。
在校庆期间，学校还举办了钱学森图书馆的命名、思源活动中心的命名、百年校庆纪念碑及四大发明广场雕塑群落成、白居易故居“东亭”落成、科技成果交流洽谈会、百年校庆展览馆开幕、钟兆琳塑像揭幕、宪梓堂揭幕、巨型塔钟揭幕典礼以及各种学术活动。在图书馆揭幕仪式上，国防科工委副主任王统业少将宣读了钱学森学长的书面讲话，江泽民学长亲自题写了馆名。
校庆期间，为表彰对交通大学，特别是学校西迁以来辛勤耕耘的广大教职工，学校对做出杰出贡献的赵富鑫、周惠久、陈学俊、蒋大宗、顾崇衔、陆庆乐、王季梅授予了“西安交通大学杰出教授称号”，对史维祥、程润田等1371名西迁教工，颁发了纪念迁校四十周年荣誉证书。
4月7日下午，由参加我校校庆的两院院士在科学馆会议厅门前，植下了代表中国科学院院士和中国工程院院士的两株松树；学校还专门将葛洲坝水利集团公司捐赠的三峡基石树为“千秋石”。同日，在科学馆，伯克利加州大学校长田长霖院士在科学馆为广大师生做了“21世纪高等工程教育与科学研究”的报告。8日下午，在科学馆举行百年校庆科学报告会，郑哲敏、谢光选和杨叔子三位院士分别做了精彩的学术报告。当日晚上，学校举行了百年校庆文艺晚会，电影晚会和礼花篝火晚会。4月9日，召开了校友会茶话会和捐赠单位、协作单位茶话会。
另外，俞宗瑞（1947届老校友，解放前曾任交通大学中共地下党组织总支书记，上海徐汇龙华区学委书记）和蔡睟盎（蔡元培之女，解放前中共地下党员）两位学长受邀为西安交大师生做了“交通大学光荣革命传统”的报告；学校还举行了唐文治教育思想研讨会暨《唐文治教育文选》发行仪式。
在6月29日，到7月1日，百年校庆第二阶段活动举行，来自9国154名海外校友及亲属参加了活动。
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