西安医科大学前身为1937年由国立北平大学医学院部分师生成立的西安临时大学医学院。1938年,当时的国民政府教育部将西安临时大学更名为国立西北联合大学,1939年改名为国立西北医学院。1945年8月,国民政府教育部决定西北医学院与国立西北大学合并,改称国立西北大学医学院。1949年,陕西省立医学专科学校并入西北大学医学院。1950年教育部决定将西北大学医学院独立,改名为西北医学院,1956年教育部、卫生部联合通知,将西北医学院改称为西安医学院,隶属陕西省管理,1978年经卫生部与陕西省政府协商,将西安医学院划为卫生部部属高等医学院校。1985年经卫生部批准改名为西安医科大学。2000年4月西安医科大学、陕西财经学院和西安交通大学合并。
本全宗包括西安医科大学从1937年成立到2000年与西安交通大学合并前的63年间形成的档案共20170卷。其中,1949年以前档案646卷,主要内容包括教育部关于教育工作的训令、学校各项规章制度介绍、学生学习情况介绍以及教职员册等,剩余19524卷档案分党群、行政、教学、科研、基建、设备、出版、外事、财会以及声像等10大类。这些丰富的档案资料不仅反映了西安医科大学六十多年的发展变迁历史,同时也是西安交通大学馆藏档案的重要组成部分。本全宗档案保存完好,基本的检索工具有案卷目录、专题目录、专题卡片等。