南洋公学--交通大学全宗所包含的档案上迄1896年,下至1959年,共3366卷,其中,清代档案85卷。该全宗档案分管理、教学及出版物、科研产品设备、房地产、财会、外事等6大类。包括盛宣怀有关南洋公学的办学奏折和官方文书,中国近代最早的高等学府管理章程--1897年南洋公学首任负责人亲书的《南洋公学章程》,中国近代第一所新式官办小学校章程--《南洋公学高等小学堂章程》,近代中国高校中第一个电机专科设立的经过--《咨呈增设电机、邮政两专科办法》,教员关于教学的意见书,清末学生成绩公布榜,晚清毕业学生文凭存根,聘任外籍教员合同,规范学生留学管理的《邮传部上海高等实业学堂出洋留学生章程》,中国近代最早的高校出版翻译机构--南洋公学译书院出版、翻译的书籍(包括20世纪初由严复翻译、南洋公学译书院出版的英国古典政治经济学家亚当·斯密的代表作--《原富》), 学生实习材料,安排课程的教务会议记录,民国时期学校因学生学习经费与各省的来往文件等一大批非常珍贵的档案以及有关日本同文书院的近百张照片和档案资料。
作为近代中国创办最早的高等学府之一,南洋公学--交通大学的成长变迁基本上能够反映新中国成立前中国高等教育事业发展的一般情况,因此从本部分档案中可以洞窥近代中国高等教育的发展历程,是研究近代中国高等教育的重要资料。同时,这部分档案还记录了盛宣怀、张元济、严复、唐文治、詹天佑、徐世昌、叶恭绰、蔡元培、陆定一、孙科、钱学森、江泽民等一批近现代知名人士在教育方面的社会活动情况,因此在晚清史、民国史以及人物专题研究方面也具有相当的重要价值。本全宗档案基本保存完好,有案卷目录等检索工具。